Физико-геологические предпосылки применения этого метода заключаются в магнитных неоднородностях горных пород, образующих геологические структуры в земной коре. Магнитное поле Земли намагничивает горные породы в различной степени, что определяется их магнитной восприимчивостью, намагниченностью и напряженностью намагничивающего поля.
Осадочные породы, являющиеся основными вместилищами газа и нефти, в большинстве своем немагнитны.